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Le riserve naturali sono strutturate con la seguente tipologia:

- riserva naturale integrale: in tali riserve si opera per la conservazione dell’ambiente naturale nella sua integrità, con l’ammissione di soli interventi a carattere scientifico.

- riserva naturale orientata: in tali aree si opera per la conservazione dell’ambiente naturale, nelle quali sono consentiti interventi culturali, agricoli e silvo-pastorali, purché non in contrasto con la conservazione dell’ambiente.

- riserva naturale speciale: tali riserve sono nate per particolari e delimitati compiti di conservazione biologica, biologico-forestale, geologica e etnoantropologica.

- riserva naturale genetica: in queste aree si opera per la conservazione del patrimonio genetico delle popolazioni e vegetali della regione.

A delimitare ogni area vi è una zona di protezione, pre-riserva, a sviluppo controllato, in cui è consentito svolgere attività artigianali, zootecniche, ricreative e sportive, tendenti a valorizzare le risorse locali.

Provincia di Agrigento - Foce del fiume Platani - Grotta di S.Angelo Muxaro - Isola di Lampedusa - Isola di Linosa e Lampione - Macalube di Aragona - Monte Cammarata - Monte Genuardo e S.M. del Bosco - Monte S. Calogero (Kronio) - Monti di Palazzo Adriano e Valle del Sosio - Torre Salsa.

Aree Marine Protette: Riserva marina Isole Pelagie

Provincia di Caltanissetta - Il Biviere di Gela - Lago Sfondato - Lago Soprano - Monte Capodarso e Valle dell'Imera Meridionale - Monte Conca - Riserva Geologica di Contrada Scaleri - Sughereta di Niscemi. ---------------------Zone umide: Il Biviere di Gela

Provincia di Catania - Bosco di Santo Pietro - Complesso Immacolatelle e Micio-Conti - Fiume Fiumefreddo - Isola Lachea e Faraglioni dei Ciclopi - Oasi del Simeto - La Timpa - kkikhgkkhihkkhikhkhih khihkkhi khkhi khkhi kh g Aree Marine Protette: Riserva marina Isole Ciclopi

Provincia di Enna - Lago di Pergusa - Monte Altesina - Monte Capodarso e Valle dell'Imera Meridionale - Rossomanno - Grottascura - Bellia - Sambuchetti - Campanito - Vallone di Piano della Corte

Provincia di Messina - Bosco di Malabotta - Fiumedinisi e Monte Scuderi - Isola di Alicudi - Isola Bella - Isola di Filicudi Isola di Panarea e Scogli Viciniori - Isola di Stromboli e Strombolicchio - Isola di Vulcano - Laghetti di Marinello - Laguna di Capo Peloro - Le Montagne delle Felci e dei Porri - Vallone Calagni sopra Tortrici

Provincia di Palermo - Bagni di Cefalà Diana e Chiarastella - Bosco della Favara e Bosco Granza - Bosco della Ficuzza, Rocca Busambra, Bosco del Cappelliere e Gorgo del Drago - Capo Gallo - Capo Rama - Grotta Conza - Grotta di Carburangeli - Grotta di Entella - Grotta dei Puntali - Isola di Ustica - Monte Carcaci - Monte Genuardo e S.M. del Bosco - Monte Pellegrino - Monte S. Calogero - Monti di Palazzo Adriano e Valle del Sosio - Pizzo Cane, Pizzo Trigna e Grotta Mazzamuto - Serre di Ciminna - Serre della Pizzuta.
Aree Marine Protette: Capo Gallo - Isola delle Femmine - Isola di Ustica

Provincia di Ragusa: Macchia Foresta Fiume Irminio - Pino d'Aleppo

Provincia di Siracusa - Cavagrande del Cassibile - Complesso speleologico Villasmundo-S. Alfio - Fiume Ciane e Saline di Siracusa - Grotta Monello - Grotta Palombara - Oasi faunistica di Vendicari - Pantalica, Valle dell'Anapo, Torrente Cava Grande - Saline di Priolo. Aree Marine Protette: Plemmirio

Provincia di Trapani - Bosco di Alcamo - Foce del fiume Belice e dune limitrofe - Grotta di Santa Ninfa - Isola di Pantelleria - Isole dello Stagnone di Marsala - Lago Preola e Gorghi Tondi - Monte Cofano - Saline di Trapani e Paceco - Zingaro

Aree Marine Protette: Riserva marina Isole Egadi